Novi kriterij za ekstrakciju DNK iz okolišnih voda — Bigefei sekvenciranje ubrzava naučna istraživanja

Ovaj komplet se zasniva na optimiziranom puferskom sistemu kombinovanom sa visokoučinkovitim nano magnetskim kuglicama. Genomska DNK se specifično veže za funkcionalne grupe na površini kuglica i odvaja se pod djelovanjem vanjskog magnetskog polja. Nakon višestrukih nježnih koraka ispiranja radi uklanjanja proteina, soli i drugih nečistoća, konačno se eluira genomska DNK visoke čistoće.

Specijalno dizajniran za uzorke vode iz okoliša, komplet efikasno ekstrahuje bakterijsku DNK prikupljenu na filterskim membranama, uključujući gram-negativne i gram-pozitivne bakterije (do 2 × 10⁹ bakterijskih ćelija po jednoj filterskoj membrani). Kompatibilan je sa potpuno automatizovanim sistemima za ekstrakciju nukleinskih kiselina za visokopropusnu obradu. Ekstrahovana DNK je konzistentnog kvaliteta i može se direktno koristiti za PCR/qPCR, NGS i druge naknadne primjene.

Karakteristike proizvoda

1. Mogućnost ekstrakcije bakterija širokog spektra

Efikasno ekstrahuje i gram-negativne i gram-pozitivne bakterije iz uzoraka vode, pokrivajući mikrobne zajednice koje se obično nalaze u slatkovodnom i morskom okruženju i ispunjavajući različite analitičke zahtjeve.

2. Visoka čistoća i visok prinos

Pruža DNK visoke čistoće, bez inhibitornih nečistoća i stabilnih prinosa pogodnih za direktne molekularne primjene.

3. Automatizirana i visokoefikasna kompatibilnost

Potpuno kompatibilan sa Bigfish automatiziranim sistemima za ekstrakciju nukleinskih kiselina, podržavajući istovremenu obradu 32 ili 96 uzoraka, značajno smanjujući vrijeme obrade i poboljšavajući efikasnost laboratorije.

4. Siguran i jednostavan rad

Nema potrebe za toksičnim organskim reagensima poput fenola ili kloroforma, što minimizira sigurnosne rizike u laboratoriji. Osnovni reagensi su unaprijed zapakirani u ploče s 96 jažica, što smanjuje greške pri ručnom pipetiranju i pojednostavljuje radne procese.

Kompatibilni instrumenti

Bigfish BFEX-16E

BFEX-32

BFEX-32E

BFEX-96E

Eksperimentalni rezultati

Uzorak riječne vode od 600 mL filtriran je kroz membranu, a DNK je ekstrahirana korištenjem Bigfish kompleta za ekstrakciju i prečišćavanje genomske DNK iz okolišne vode na bazi magnetskih kuglica, zajedno s kompatibilnim instrumentom. Ekstrahirana DNK je potom analizirana elektroforezom na agaroznom gelu.